El distrito de El Agustino fue creado políticamente el 06 de Enero de 1965 mediante la Ley 15353. Con la dación de esta Ley, a inicios del 1960, se reconocieron como zonas marginales a los asentamientos surgidos de ocupaciones violentas en la zona de cerros, como de aquellos originadas mediante traspasos. En este periodo, la Zona se encontraba tugurizada, contaba con una densidad de 443 habitantes por Ha., lo que obligó a iniciar un proceso de remodelación que no ha concluido a la fecha. A consecuencia de los procesos de remodelación y destugurización de la parte plana, se plantea la expropiación y la consiguiente ocupación del área ubicada en la margen izquierda de la vía Evitamiento, paralela a la actual Av. 1ro de Mayo. Allí se instalan los A.H. de Villa Hermosa, Nocheto, Los Eucaliptos, Los Perales. Estos A.H. avanzaron mas rápidamente en el aspecto de saneamiento físico legal. Obtuvieron sus títulos pero tuvieron problemas para inscribirlos en los Registros Públicos. En este mismo periodo surgen sobre los terrenos agrícolas escasas urbanizaciones convencionales como Los Ficus, La Achirana, La Asociación Primavera, La cooperativa Huancayo y San José, así como las Cooperativas Populares Universal. Los Chancas de Andahuaylas, Tayacaja y otros. Asi de esta manera nació lo que hoy conocemos como el Distrito de El Agustino.
En el Año 1989, durante el primer gobierno del Dr. Alan García Pérez, el distrito de El Agustino sufrio un recorte en su territorio siendo el Alcalde Don Jorge Quintanilla Alarcón. El recorte se produjo con la Ley de Creación del distrito de Santa Anita. Se argumenta que las zonas que comprende este distrito no recibian los servicios optimamente tanto de la Municipalidad de El Agustino como de Ate. Por lo tanto la población optó por ese camino.
